- São José dos Campos tem o Hospital Municipal, que mantém um centro de Residência Médica com experiência já reconhecida pelo MEC. São José tem 963 leitos hospitalares do SUS na rede pública e instituições conveniadas. O setor da saúde tem sido o ponto mais criticado da administração petista no município.

A criação de novos cursos particulares de medicina faz parte do programa Mais Médicos, lançado pelo governo federal. O objetivo é proporcionar melhorias no atendimento aos usuários do SUS, acelerar os investimentos.